SPR·LigandTracer 고급 분석 계산기 II
평형분석, 분석물 고갈 체크, 경쟁결합, 싱글사이클 카이네틱 스케줄까지
평형(Steady-state) KD 계산기
결합·해리 속도가 너무 빨라 카이네틱 피팅이 어려울 때, 평형 반응값(Req)만으로 KD를 추정합니다.
| 분석물 농도 (nM) | 평형 반응값 Req (RU) | 계산된 KD (nM) |
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계산식 · Req = Rmax×C ÷ (KD+C) 를 KD에 대해 정리하면 KD = C×(Rmax−Req) ÷ Req · 각 농도점에서 계산된 KD가 서로 비슷할수록(오차 작을수록) 1:1 결합모델이 잘 맞는다는 뜻입니다.
분석물 고갈(Depletion) 체크 계산기
LigandTracer처럼 흐름 없이 고정된 부피에서 측정하는 실험은, 분석물이 결합되며 농도가 실제로 줄어들 수 있습니다. 이 정도를 미리 확인하세요.
계산식 · 최대 고갈률(%) = 타겟 총량(mol) ÷ 분석물 총량(mol) × 100 · 일반적으로 10% 이하면 자유 농도가 거의 일정하다고 가정할 수 있어 카이네틱 분석에 안전합니다. 이를 초과하면 부피를 늘리거나 타겟 양을 줄이는 것을 고려하세요.
Cheng-Prusoff Ki 계산기
경쟁 결합(competition binding) 실험의 IC50 값을 실제 억제상수(Ki)로 보정합니다.
세 값은 모두 같은 농도 단위(예: nM)로 입력하세요.
계산식 · Ki = IC50 ÷ (1 + [L]÷KD) · IC50는 실험 조건(라벨 리간드 농도)에 따라 달라지지만, Ki는 그 영향을 보정한 고유 값입니다.
싱글사이클 카이네틱(SCK) 스케줄러
재생(regeneration) 없이 농도를 순차적으로 올려가며 주입하는 싱글사이클 실험의 전체 소요시간과 사이클별 일정을 계산합니다.
| 단계 | 소요시간 | 시작 | 종료 |
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사이클 간 해리시간은 완전한 해리가 아니라 다음 주입 전 신호를 안정시키는 짧은 구간이며, 마지막 사이클 이후에만 전체 해리 과정을 관찰합니다.